Raiden
En los años 80, Jack participó en una guerra civil, seguramente en continente africano. Era el mejor soldado de un grupo formado por niños-soldado, por lo que recibió el liderazgo del batallón y el apodo de "Jack el Destripador" y "La Muerte Blanca" (posiblemente por el color de su pelo). En esa época conoció a George Sears (Solidus Snake), quien le adiestró y le enseñó todas sus habilidades como soldado y guerrero. Al finalizar el conflicto, el resto de los miembros de su unidad regresaron a sus respectivos países, conviviendo con su dolor y recuerdos de infancia, sin embargo Jack los reprimió, olvidando completamente su pasado.

Al regresar a los Estados Unidos, Jack fue captado por los Patriots. Fue sometido a un entrenamiento en realidad virtual, aprendiendo el manejo de armas, desarrollando sus habilidades y el pensamiento estratégico en un entorno digital. Debido a éste adiestramiento Jack desarrolló una falta de sensación de la realidad, llegando a dudar de sus propios recuerdos. En 2009, dos años después del incidente del buque Discovery, Jack fue enviado al Big Shell en una misión de infiltración. Al principio recibió el nombre en clave de Snake, pero poco después Roy Campbell decidió cambiarlo por Raiden, quien supuestamente era un joven miembro de Fox-Hound, enviado en su primera misión de combate real desde que inició su entrenamiento virtual


Roy Campbell
Durante los sucesos que ocurrieron durante en el Big Shell, el coronel Roy Campbell apareció como oficial responsable de FOX-HOUND, cuando dicha unidad había sido desmantelada. Su misión consistía en apoyar a Raiden del mismo modo en que apoyó a Solid Snake


Rosemary
Novia de Raiden en la vida real, se unió a la misión para poder seguir su seguimiento a pesar de no formar parte de Fox-Hound oficialmente. Representa el mismo rol que realizó Mei Ling en Metal Gear Solid, u Otacon en la misión del buque. 


Solidus Snake:
Es uno de los clones de Big Boss,  "Solidus Snake, Liquid Snake y Solid Snake".

A Solidus se le escucha por primera vez mientras mantiene una conversación telefónica con Revólver Ocelot al final del juego en Metal Gear Solid, siendo su nombre real "George Sears" (Presidente de los Estados Unidos). En Metal Gear Solid 2: Sons of Liberty aparece pero no como Presidente ya que dimitió por expresa orden de Los Patriots, y ahora es el líder jefe y miembro de una organización antiguamente antiterrorista y ahora terrorista llamada Dead Cell conformada por miembros tales como "Vamp, Fortune y Fatman" .


Vamp: Es uno de los Miembros de la Unidad Dead Cell dirigida ahora por Solidus Snake (George Sears antiguo Presidente de los EE.UU).

- De origen rumano y extraños poderes y habilidades, Vamp es el miembro más tenebroso de Dead Cell. Posee una agilidad y velocidad sobrehumanas, sus sentidos están tan agudizados que puede adivinar las intenciones de sus rivales observando el movimiento de sus músculos. 


Fatman
Antiguo discípulo de Peter Stillman, Fatman es un experto en bombas, sin embargo su talento lo utiliza para actividades criminales y terroristas. Viste un traje de artificiero y se mueve en patines debido a su peso que le impide moverse con rápidez. Accede a la toma del Big Shell con la condición de que acudiera Peter Stillman


Fortune
Helena Scott Dolph es la hija del comandante Dolph, marine muerto en el incidente del U.S. Discovery dos años antes. Posee una extraña habilidad que ella considera una maldición, ninguna bala es capaz de alcanzarla, y por consiguiente, nadie es capaz de matarla.